データセット ID
JGAD000938
- データの種類
- NGS(WGS)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 415 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0580
- 公開日
- 2026-05-21
- 更新日
- 2026-05-21
- DDBJ Search
- JGAD000938 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000796 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 子宮頸部胃型腺がん(ICD10:C539):1症例
腫瘍組織:2検体
腫瘍組織より作製したオルガノイド:2検体
正常組織(PBMC):1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 子宮頸部胃型腺がん
- 試料説明
- 腫瘍組織、腫瘍オルガノド、ならびに正常組織から抽出したDNA
- 組織子宮頸部、オルガノイド、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp