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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000938

データの種類
NGS(WGS)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
415 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0580
公開日
2026-05-21
更新日
2026-05-21

解析手法

WGS

材料と対象者
子宮頸部胃型腺がん(ICD10:C539):1症例
腫瘍組織:2検体
腫瘍組織より作製したオルガノイド:2検体
正常組織(PBMC):1検体
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    1 (人数)
疾患
  • 子宮頸部胃型腺がん
試料説明
腫瘍組織、腫瘍オルガノド、ならびに正常組織から抽出したDNA
  • 組織
    子宮頸部、オルガノイド、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    混在
試料の入手元
N/A
実験方法
WGS
測定対象
N/A
試薬キット
NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5
断片化
超音波断片化
プラットフォーム
Illumina NovaSeq 6000
リードタイプ
ペアエンド
リード長
150 bp