データセット ID
JGAD000937
- データの種類
- NGS(scRNA-seq、scTCR-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 93.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- BAI
- CSV
- JSON
- HDF5
- 研究
- hum0513
- 公開日
- 2026-09-08
- 更新日
- 2026-09-08
- DDBJ Search
- JGAD000937 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000795 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- COVID-19ワクチン接種者(健常人):14名
ワクチン3回目接種1年後の末梢血単核球(PBMC): 14検体 - 健康状態健常
- 対象者数14 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- PBMCから抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- STAR
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- Cell Ranger 7.1.0
- 遺伝子数
- 25,170
scTCR-seq
- 材料と対象者
- COVID-19ワクチン接種者(健常人):14名
ワクチン3回目接種1年後の末梢血単核球(PBMC): 14検体 - 健康状態健常
- 対象者数14 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- PBMCから抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- TCR-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Single Cell Human TCR Amplification Kit
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- STAR
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- Cell Ranger 7.1.0