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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000937

データの種類
NGS(scRNA-seq、scTCR-seq)
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
93.6 GB
ファイル形式
  • FASTQ
  • BAM
  • BAI
  • CSV
  • JSON
  • HDF5
研究
hum0513
公開日
2026-09-08
更新日
2026-09-08

解析手法

scRNA-seq

材料と対象者
COVID-19ワクチン接種者(健常人):14名
ワクチン3回目接種1年後の末梢血単核球(PBMC): 14検体
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    14 (人数)
  • 対象集団
    日本人
試料説明
PBMCから抽出したRNA
  • 組織
    末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
試料の入手元
N/A
実験方法
scRNA-seq
測定対象
N/A
試薬キット
Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
断片化
上記キットに準拠
プラットフォーム
MGI DNBSEQ-G400
リードタイプ
ペアエンド
リード長
100 bp
参照ゲノム
GRCh38
マッピング
STAR
QC・フィルタリング
N/A
解析方法
Cell Ranger 7.1.0
遺伝子数
25,170

scTCR-seq

材料と対象者
COVID-19ワクチン接種者(健常人):14名
ワクチン3回目接種1年後の末梢血単核球(PBMC): 14検体
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    14 (人数)
  • 対象集団
    日本人
試料説明
PBMCから抽出したRNA
  • 組織
    末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
試料の入手元
N/A
実験方法
TCR-seq
測定対象
N/A
試薬キット
Chromium Single Cell Human TCR Amplification Kit
断片化
上記キットに準拠
プラットフォーム
MGI DNBSEQ-G400
リードタイプ
ペアエンド
リード長
100 bp
参照ゲノム
GRCh38
マッピング
STAR
QC・フィルタリング
N/A
解析方法
Cell Ranger 7.1.0