データセット ID
JGAD000925
- データの種類
- scRNA-seqデータ、血漿プロテオームデータ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.1 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- TSV
- 研究
- hum0197
- 公開日
- 2025-04-30
- 更新日
- 2025-04-30
- DDBJ Search
- JGAD000925 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000783 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0197_ | 10.2 KB |
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- COVID-19患者（ICD10：U071）：30＋43＋15症例
健常者：31＋44＋27名 - 健康状態混在
- 対象者数190 (人数)
- 疾患
- COVID-19患者
- 試料説明
- 末梢血単核細胞から抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Chip G Single Cell Kit
Chromium Next GEM Single Cell 5' v1.1
Single Index Kit T Set A - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 91 bp
- 表現型データの有無
- あり
Protein expression (2932 proteins)
- 材料と対象者
- COVID-19感染者（ICD-10：U071）：83症例
健常者：144名 - 健康状態混在
- 対象者数227 (人数)
- 疾患
- COVID-19感染者
- 試料説明
- 血漿
- 組織血漿
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Proteomics
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Olink Explore 3072
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Olink Explore 3072
- リードタイプ
- N/A
- リード長
- N/A
- 正規化
- Normalized Protein eXpression（NPX）
- 解析方法
- Olink Analyze R package