データセット ID
JGAD000924
- データの種類
- 乳がん10,008症例、胃がん10,576症例、大腸がん13,922症例および心不全6,038症例、脳梗塞10,486症例などを含む計140,597名を対象としたTP53のTarget Capture Sequencingデータ
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 170 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2025-06-05
- 更新日
- 2025-06-05
- DDBJ Search
- JGAD000924 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000782 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 乳がん(ICD10:C509):10,008症例
胃がん(ICD10:C16):10,576症例
大腸がん(ICD10:C18):13,922症例
心不全(ICD10:I50):6,038症例
脳梗塞(ICD10:I63):10,486症例
など
合計:140,597名 - 健康状態罹患
- 対象者数140,597 (人数)
- 疾患
- 乳がん
- 胃がん
- 大腸がん
- 心不全
- 脳梗塞
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- TP53の翻訳領域
- 試薬キット
- KAPA HiFi DNA Polymerase
2X Platinum Multiplex PCR Master Mix - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp