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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000924

データの種類
乳がん10,008症例、胃がん10,576症例、大腸がん13,922症例および心不全6,038症例、脳梗塞10,486症例などを含む計140,597名を対象としたTP53のTarget Capture Sequencingデータ
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
170 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0014
公開日
2025-06-05
更新日
2025-06-05

解析手法

Targeted DNA sequencing

材料と対象者
乳がん(ICD10:C509):10,008症例
胃がん(ICD10:C16):10,576症例
大腸がん(ICD10:C18):13,922症例
心不全(ICD10:I50):6,038症例
脳梗塞(ICD10:I63):10,486症例
など
合計:140,597名
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    140,597 (人数)
疾患
  • 乳がん
  • 胃がん
  • 大腸がん
  • 心不全
  • 脳梗塞
試料説明
末梢血から抽出したgDNA
  • 組織
    末梢血
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
Targeted DNA sequencing
測定対象
TP53の翻訳領域
試薬キット
KAPA HiFi DNA Polymerase
2X Platinum Multiplex PCR Master Mix
断片化
N/A
プラットフォーム
Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000
リードタイプ
ペアエンド
リード長
150 bp