データセット ID
JGAD000901
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 272 GB
- ファイル形式
- BAM
- BAI
- 研究
- hum0405
- 公開日
- 2025-12-03
- 更新日
- 2025-12-03
- DDBJ Search
- JGAD000901 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000760 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- B細胞性前リンパ球性白血病（ICD10：C91.3）：16症例 （寛解9症例、再発7症例）
CAR-T製剤中のT細胞をソートしたCD38-CD73-Tim-3-HLA-DR+（4 marker-defined; 4MD）分画：13検体（寛解7症例、再発6症例）
4MD以外の分画：16検体（寛解9症例、再発7症例） - 健康状態罹患
- 対象者数16 (人数)
- 年齢層小児
- 疾患
- B細胞性前リンパ球性白血病
- 試料説明
- 腫瘍細胞もしくはT細胞から抽出したRNA
- 組織骨髄、末梢血、T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
MGI DNBSEQ-G400 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- Genomon v2.6.2/v2.6.3
- マッピング品質
- unmapped reads < 5%
- カバレッジ (割合)
- ユニークにマップされたリードの割合: 90% (超)