データセット ID
JGAD000897
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.2 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0445
- 公開日
- 2025-05-21
- 更新日
- 2025-11-11
- DDBJ Search
- JGAD000897 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000756 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 肺腺がん（ICD10：C34.1、C34.2、C34.3）：362症例
腫瘍組織：362検体
非腫瘍組織：8検体 - 健康状態罹患
- 対象者数362 (人数)
- 疾患
- 肺腺がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- mRNA-Seq Sample Prep Kit
TruSeq RNA Library Prep Kit
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina Genome Analyzer IIx
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75 bp
100 bp
WES
- 材料と対象者
- 非小細胞肺がん（ICD10：C34.9）：8症例
腫瘍組織と非腫瘍組織（血液または正常肺組織）のペア：15検体 合計30検体 - 健康状態罹患
- 対象者数8 (人数)
- 疾患
- 非小細胞肺がん
- 試料説明
- 腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- HiSeq2500: 75 bp (ペアエンド表記)
HiSeq2500: 100 bp (ペアエンド表記)
NovaSeq 6000: 150 bp