データセット ID
JGAD000895
- データの種類
- NGS（WGS、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 667 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0485
- 公開日
- 2025-04-30
- 更新日
- 2025-04-30
- DDBJ Search
- JGAD000895 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000754 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16.9）：65 症例
腫瘍組織：65検体
非腫瘍組織：65検体 - 健康状態罹患
- 対象者数65 (人数)
- 疾患
- 胃がん (C169)
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 126 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16.9）：65症例
腫瘍組織：65検体 - 健康状態罹患
- 対象者数65 (人数)
- 疾患
- 胃がん (C169)
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- KAPA RNA HyperPrep Kit with RiboErase
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 126 bp