データセット ID
JGAD000888
- データの種類
- JGAD000235の加工データ（ミトコンドリアのバリアントコール）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 773 KB
- ファイル形式
- VCF
- IDX
- 研究
- hum0159
- 公開日
- 2024-10-17
- 更新日
- 2024-10-17
- DDBJ Search
- JGAD000888 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000157 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 大腸がん（ICD10：C18）：10 症例
腫瘍組織：10 検体
非腫瘍組織：10 検体 - 健康状態罹患
- 対象者数10 (人数)
- 疾患
- 大腸がん (C18)
- 試料説明
- 大腸がん切除切片における非腫瘍組織および腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA Sample Prep Kit
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 加工データの種類
- 変異コール