データセット ID
JGAD000856
- データの種類
- NGS（RNA-seq、scRNA-seq、scBCR-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 288 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0464
- 公開日
- 2024-07-25
- 更新日
- 2025-06-19
- DDBJ Search
- JGAD000856 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000723 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 多発性骨髄腫（ICD10：C90.0）：17症例
骨髄（腫瘍組織）：86＋14検体
11分画：8症例 60＋2検体
CD138陽性・陰性ペア： 13症例 26＋12検体
正常骨髄：3検体
形質細胞分画：3検体 - 健康状態混在
- 対象者数244 (混在)
- 疾患
- 多発性骨髄腫 (C900)
- 試料説明
- 骨髄（腫瘍組織）由来の11分画検体およびCD138陽性・陰性単核球検体ならびに正常骨髄の形質細胞分画から抽出したRNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- 正常骨髄（Lonza社、2M-125C）
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina
SMART-Seq HT Kit
SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina NextSeq 2000
Illumina NextSeq 500 - リードタイプ
- 混在
- リード長
- 70 bp
90 bp
scRNA-seq + scBCR-seq
- 材料と対象者
- 多発性骨髄腫（ICD10：C90.0）：9症例
骨髄（腫瘍組織）：22検体
（scRNA-seqとscBCR-seqで11検体ずつ） - 健康状態罹患
- 対象者数31 (混在)
- 疾患
- 多発性骨髄腫 (C900)
- 試料説明
- 骨髄（腫瘍組織）由来のCD38陽性単核球検体から抽出したRNA
- 組織骨髄
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- BCR-seq
scRNA-seq - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
Chromium Single Cell Human BCR Amplification Kit - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 90 bp