データセット ID
JGAD000834
- データの種類
- 胃がん2,067症例のWGSデータ（low-depth）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 18.7 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2024-05-27
- 更新日
- 2024-05-27
- DDBJ Search
- JGAD000834 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000701 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- バイオバンク・ジャパン第1コホートに含まれる糖尿病（ICD10：E11）：2,162症例
バイオバンク・ジャパン第1コホートに含まれる胃がん（ICD10：C16）：2,067症例 - 健康状態罹患
- 対象者数4229 (人数)
- コホートBioBank Japan
- 疾患
- バイオバンク・ジャパン第1コホートに含まれる糖尿病
- バイオバンク・ジャパン第1コホートに含まれる胃がん
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 125 bp