データセット ID
JGAD000830
- データの種類
- Xenium In Situ Gene Expression
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 183 GB
- ファイル形式
- TAR
- 研究
- hum0454
- 公開日
- 2024-12-12
- 更新日
- 2024-12-12
- DDBJ Search
- JGAD000830 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000697 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| target_ | 427遺伝子 | 15.0 KB |
解析手法
Xenium 空間トランスクリプトーム
- 材料と対象者
- Crohn病（ICD10：K509）：10症例
術前にステロイドや生物学的製剤などの強い治療を行っていない症例：8症例
TNFα阻害薬を投与している症例：2症例
潰瘍性大腸炎：4症例
サイトメガロウィルス腸炎：1症例
がん：1症例 - 健康状態罹患
- 対象者数16 (人数)
- 疾患
- Crohn病 (K509)
- 試料説明
- 手術摘出検体（FFPE）
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Spatial transcriptomics
- 測定対象
- 427遺伝子（multi tissue panel：377遺伝子、カスタム：50遺伝子）
- 試薬キット
- Xenium Decoding Consumables
Xenium Decoding Reagents
Xenium Slides & Sample Prep Reagents - プラットフォーム
- 10x Genomics Xenium Analyzer
- 解析方法
- xenium-1.7.1.0