データセット ID
JGAD000829
- データの種類
- NGS（WGS）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 28.5 TB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0447
- 公開日
- 2026-06-10
- 更新日
- 2026-06-10
- DDBJ Search
- JGAD000829 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000696 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 大腸がん（ICD10：C189）：138症例（内10症例は腫瘍組織のみ）
腫瘍組織：138検体
非腫瘍組織（血液細胞）：128検体
合計：266検体 - 健康状態罹患
- 対象者数138 (人数)
- 疾患
- 大腸がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- BWA-MEM（version 0.7.8）
- マッピング品質
- マッピング率 平均99.5%
- カバレッジ (深度)
- 腫瘍組織: 51.4x
非腫瘍組織: 38.1x