データセット ID
JGAD000795
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 5.7 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0435
- 公開日
- 2024-03-18
- 更新日
- 2024-03-18
- DDBJ Search
- JGAD000795 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000665 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- HLAホモ健常ドナー1名の末梢血細胞から樹立されたヒトiPS細胞を分化誘導した心筋細胞：1検体
- 健康状態健常
- 対象者数1 (検体数)
- 試料説明
- iPS細胞から分化誘導した心筋細胞から抽出したRNA
- 組織iPSC-derived cardiomyocyte
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Nextera XT DNA Library Prep Kit
- 断片化
- Nextera XT DNA sample preparation Kit
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- STAR（mappa/hanta pipeline）
- QC・フィルタリング
- Cutadapt（mappa/hanta pipeline）
- 解析方法
- Subread（mappa/hanta pipeline）
- 遺伝子数
- 58,736