データセット ID
JGAD000773
- データの種類
- NGS（WGS、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 85.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0429
- 公開日
- 2023-10-31
- 更新日
- 2023-10-31
- DDBJ Search
- JGAD000773 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000643 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- ヒト肺がん（ICD10：C349）細胞株LU99を移植したマウスの腫瘍組織：計16検体
Xenograftマウスの腫瘍細胞に対して、薬剤（JDQ443＋TNO155＋alpelisib＋ribociclib）もしくは溶媒（対照）を投与し、3時間後および24時間後に採取した細胞：各4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数24 (検体数)
- 疾患
- ヒト肺がん (C349)
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- LU99
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II DNA PCR-free Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 51 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- ヒト肺がん（ICD10：C349）細胞株LU99を移植したマウスの腫瘍組織：計16検体
Xenograftマウスの腫瘍細胞に対して、薬剤（JDQ443＋TNO155＋alpelisib＋ribociclib）もしくは溶媒（対照）を投与し、3時間後および24時間後に採取した細胞：各4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数24 (検体数)
- 疾患
- ヒト肺がん (C349)
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- LU99
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 50 bp