現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000767

データの種類: NGS（WGS）
NGS（scRNA-seq、scATAC-seq）
CyTOF
Olink
メチル化アレイ
アクセス制限: 制限公開（Type I）
総データ量: 14.0 TB
ファイル形式: FASTQ
TXT
CSV
研究: hum0290
公開日: 2025-06-09
更新日: 2026-08-27
DDBJ Search: JGAD000767 (新しいタブで開きます)
JGA Study: JGAS000637 (新しいタブで開きます)

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解析手法

WGS

材料と対象者: 健常者：51名（51検体）; 健康状態
健常
対象者数
51 (人数)
年齢層
成人
試料説明: 末梢血から抽出したDNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: WGS
測定対象: N/A
試薬キット: MagAttract HMW DNA Kit
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
断片化: 超音波断片化（Covaris）
プラットフォーム: MGI DNBSEQ-T7
リードタイプ: ペアエンド
リード長: 150 bp
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

scRNA-seq + scATAC-seq

材料と対象者: 健常者：94名（125検体）; 健康状態
健常
対象者数
94 (人数)
年齢層
成人
試料説明: 末梢血より単離した細胞から抽出したDNAおよびRNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: scATAC-seq
scRNA-seq
測定対象: N/A
試薬キット: Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
断片化: 酵素反応
プラットフォーム: Illumina NovaSeq 6000
Illumina NovaSeq X
リードタイプ: ペアエンド
リード長: scRNA-seq: 118 bp
scATAC-seq: 99 bp
参照ゲノム: GRCh38
解析方法: CellRanger-arc（ver2.0.0）
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

Mass cytometry (CyTOF)

材料と対象者: 健常者：43名（43検体）; 健康状態
健常
対象者数
43 (人数)
年齢層
混在
試料説明: 末梢血から単離した細胞; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: CyTOF
測定対象: 免疫応答に関する30蛋白質
試薬キット: Maxpar Direct Immune Profiling Assay
プラットフォーム: Fluidigm Helios
解析方法: Maxpar Pathsetter （Cat. #401018）
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

Proteomics (Olink, batch1: 2941 / batch2: 2939 proteins)

材料と対象者: 健常者：35名（35検体）; 健康状態
健常
対象者数
35 (人数)
年齢層
混在
試料説明: 血漿; 組織
血漿
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: Proteomics
測定対象: N/A
試薬キット: Olink Explore 3072
断片化: N/A
プラットフォーム: Olink Explore 3072
リードタイプ: N/A
リード長: N/A
正規化: NPX manager
解析方法: NPX manager
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)

メチル化アレイ

材料と対象者: 健常者：51名（88検体）; 健康状態
健常
対象者数
51 (人数)
年齢層
混在
試料説明: 末梢血から抽出したDNA; 組織
末梢血
腫瘍 / 非腫瘍
非腫瘍
試料の入手元: N/A
実験方法: Methylation array
測定対象: N/A
試薬キット: EZ DNA Methylation Kit
Infinium HumanMethylation450 BeadChip Kit
プラットフォーム: Illumina Infinium MethylationEPIC
QC・フィルタリング: N/A
正規化: N/A
解析方法: iScan system、GenomeStudio Software
プローブ数: 865,918 プローブ
利用ポリシー: NBDC データ共有ポリシー (JGAP000001)