データセット ID
JGAD000740
- データの種類
- NGS（Amplicon-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 54.0 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0344
- 公開日
- 2023-05-10
- 更新日
- 2023-05-10
- DDBJ Search
- JGAD000740 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000611 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA Amplicon-seq
- 材料と対象者
- 慢性腎臓病ステージG1、G2、G4、G5 （ICD10：N18.1、N18.2、N18.4、N18.5）：77症例（78検体）
HEK293細胞株：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数77 (人数)
- 疾患
- G5 (N181, N182, N184, N185)
- 試料説明
- 慢性腎臓病症例の非腫瘍組織およびHEK293細胞株から抽出したミトコンドリアDNA
- 組織腎臓
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- HEK293
- 実験方法
- Amplicon-seq
- 測定対象
- ミトコンドリアゲノム
- 試薬キット
- KAPA Hyper Prep Kit
TruSeq DNA Sample Prep Kit - 断片化
- 超音波断片化 (Covaris)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 126 bp