データセット ID
JGAD000735
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、scATAC-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 318 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0391
- 公開日
- 2024-09-25
- 更新日
- 2024-09-25
- DDBJ Search
- JGAD000735 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000606 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq + scATAC-seq
- 材料と対象者
- 舌がん（ICD10：C01、C02）：4症例
腫瘍組織から樹立したオルガノイド：4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数4 (人数)
- 疾患
- 舌がん (C01, C02)
- 試料説明
- オルガノイドから抽出したDNAおよびRNA
- 組織オルガノイド
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scATAC-seq
scRNA-seq - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- scRNA-seq: 118 bp
scATAC-seq: 99 bp