データセット ID
JGAD000729
- データの種類
- メタゲノム
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.6 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0197
- 公開日
- 2023-03-30
- 更新日
- 2023-03-30
- DDBJ Search
- JGAD000729 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000600 (新しいタブで開きます)
解析手法
Metagenomics
- 材料と対象者
- 日本人：88 名（ショットガンシークエンス）
健常者：73 名（120検体）（ショットガンシークエンス）
- フェノール・クロロホルム法によるDNA抽出：73検体
- DNeasy PowerSoil Pro KitによるDNA抽出：47検体
日本人：5 名（高深度ショットガンシークエンス） - 対象者数166 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 便より抽出したDNA
- 組織便
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Metagenomics
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- KAPA Hyper Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp