データセット ID
JGAD000728
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 169 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0385
- 公開日
- 2024-01-12
- 更新日
- 2024-01-12
- DDBJ Search
- JGAD000728 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000599 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 細胆管細胞がん(ICD10:C221):8症例
腫瘍組織:8検体、非腫瘍組織:8検体、再発巣:2検体
混合型肝がん(ICD10:C227):13症例
腫瘍組織:13検体、非腫瘍組織:13検体、再発巣:2検体 - 健康状態罹患
- 対象者数21 (人数)
- 疾患
- 細胆管細胞がん (C221)
混合型肝がん (C227) - 試料説明
- 腫瘍組織、非腫瘍組織、および再発巣から抽出したDNA
- 組織肝臓
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化 (Covaris LE220)
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp