データセット ID
JGAD000704
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、scVDJ-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 511 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TSV
- 研究
- hum0379
- 公開日
- 2023-11-20
- 更新日
- 2023-11-20
- DDBJ Search
- JGAD000704 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000578 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq + scVDJ-seq
- 材料と対象者
- MG （ICD10：G70.0）：2症例（CD4+T細胞・B細胞の2検体ずつ）
MS（ICD10：G35）：4症例（CD4+T細胞・B細胞の2検体ずつ3症例、CD4+T細胞とB細胞の混合1検体）
SLE（ICD10：M32.9）：3症例（CD4+T細胞・B細胞の2検体ずつ2症例、CD4+T細胞1検体）
健常者：3名（CD4+T細胞・B細胞の2検体ずつ） - 健康状態混在
- 対象者数12 (人数)
- 疾患
- MG (G700)
MS (G35)
SLE (M329) - 試料説明
- 末梢血のCD4+T細胞およびB細胞より抽出したRNA
- 組織B 細胞、CD4 陽性 T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
VDJ-seq - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
Chromium Single Cell Human BCR Amplification Kit
Chromium Single Cell Human TCR Amplification Kit - 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 91 bp