データセット ID
JGAD000665
- データの種類
- NGS(scRNA-seq、scVDJ-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 342 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0360
- 公開日
- 2022-12-13
- 更新日
- 2022-12-13
- DDBJ Search
- JGAD000665 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000546 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq + scVDJ-seq
- 材料と対象者
- COVID-19罹患者 (ICD10:U07.1):6症例(8検体)
4症例:入院日あるいは翌日に採血
2症例:入院日あるいは翌日+退院後に採血 - 健康状態罹患
- 対象者数6 (人数)
- 疾患
- COVID-19罹患者 (U071)
- 試料説明
- 末梢血単核球(PBMC)より抽出したRNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
VDJ-seq - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Single Cell V(D)J
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- scRNA-seq: 91 bp
scVDJ-seq: 91 bp
90 bp