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NBDC ヒトデータベース
JGAD000597
公開日
2022-01-24

更新日
2022-01-25

研究
hum0320

データの種類
NGS(scRNA-seq、TCR-seq)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000480

解析手法

scRNA-seq

材料と対象者

肺腺がん(ICD10: C349): 2症例 頭頸部がん(ICD10: C760): 3症例 腫瘍組織、リンパ節、末梢血: 各1検体

実験方法

scRNA-seq

プラットフォーム

MGI [DNBSEQ-G400]

試料説明

腫瘍組織、リンパ節、末梢血から単離したT細胞から抽出したRNA

ライブラリ構築

Chromium Next GEM Single Cell 5' Reagent Kits v2

断片化

Hybrid Selection

リードタイプ

Paired-end

リード長

平均 100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

719.9 GB(fastq)

利用ポリシー

TCR-seq

材料と対象者

肺腺がん(ICD10: C349): 2症例 頭頸部がん(ICD10: C760): 3症例 腫瘍組織、リンパ節、末梢血: 各1検体

実験方法

TCR-seq

プラットフォーム

MGI [DNBSEQ-G400]

試料説明

腫瘍組織、リンパ節および末梢血から単離したT細胞から抽出したRNA

ライブラリ構築

Chromium Next GEM Single Cell 5' Reagent Kits v2

断片化

Hybrid Selection

リードタイプ

Paired-end

リード長

平均 100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

719.9 GB(fastq)

利用ポリシー