データセット ID
JGAD000597
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、TCR-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 720 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0320
- 公開日
- 2022-01-24
- 更新日
- 2022-01-24
- DDBJ Search
- JGAD000597 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000480 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 肺腺がん（ICD10：C349）：2症例
頭頸部がん（ICD10：C760）：3症例
腫瘍組織、リンパ節、末梢血：各1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数5 (人数)
- 疾患
- 肺腺がん
- 頭頸部がん
- 試料説明
- 腫瘍組織、リンパ節、末梢血から単離したT細胞から抽出したRNA
- 組織リンパ節、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- Hybrid Selection
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp (平均)
- 表現型データの有無
- あり
TCR-seq
- 材料と対象者
- 肺腺がん（ICD10：C349）：2症例
頭頸部がん（ICD10：C760）：3症例
腫瘍組織、リンパ節、末梢血：各1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数5 (人数)
- 疾患
- 肺腺がん
- 頭頸部がん
- 試料説明
- 腫瘍組織、リンパ節および末梢血から単離したT細胞から抽出したRNA
- 組織リンパ節、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- TCR-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- Hybrid Selection
- プラットフォーム
- MGI DNBSEQ-G400
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp (平均)
- 表現型データの有無
- あり