データセット ID
JGAD000506
- データの種類
- NGS（WGS）
NGS（Exome）
NGS（RNA-seq） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 670 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0103
- 公開日
- 2022-01-14
- 更新日
- 2022-01-14
- DDBJ Search
- JGAD000506 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000389 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 胆道がん（ICD10：C221, C240, C248, C23）：100 症例（KAPA：44 症例、TruSeq：73 症例、両方実施：17 症例）
腫瘍組織：100 検体（KAPA：44 検体、TruSeq：73 検体）
正常胆嚢：4 名
非腫瘍組織：4 検体 - 健康状態混在
- 対象者数104 (人数)
- 疾患
- 胆道がん
- 試料説明
- 胆道がん切除切片における腫瘍組織および膵がん手術症例から採取した正常胆嚢から抽出したRNA
- 組織Gallbladder
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- KAPA RNA HyperPrep Kit
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit - 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 101 bp
126 bp