データセット ID
JGAD000475
- データの種類
- NGS(WGS)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 201 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0306
- 公開日
- 2021-11-02
- 更新日
- 2021-11-02
- DDBJ Search
- JGAD000475 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000361 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 肝臓がん(ICD10:C220):9 症例
- 健康状態罹患
- 対象者数9 (人数)
- 疾患
- 肝臓がん (C220)
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK109)
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies MinION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 7875 bp (平均)
4715–12,070 bp (範囲)