データセット ID
JGAD000429
- データの種類
- NGS（CAGE-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 32.0 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0113
- 公開日
- 2022-08-02
- 更新日
- 2022-08-02
- DDBJ Search
- JGAD000429 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000318 (新しいタブで開きます)
解析手法
CAGE-seq
- 材料と対象者
- パーキンソン病（ICD10：G20）39症例および神経疾患を持たない対照健常者20名
PARK2変異を有するパーキンソン病（ICD10：G20）2症例（3検体）および対照健常者3名（3検体）より樹立したiPS細胞由来神経細胞とNSCのペア（6検体） - 健康状態混在
- 対象者数64 (人数)
- 疾患
- パーキンソン病 (G20)
PARK2変異を有するパーキンソン病 (G20) - 試料説明
- 全血、iPS細胞由来神経細胞、および、iPS細胞由来NSCから抽出したRNA
iPS細胞由来神経細胞＋NSC - 組織iPSC-derived neuron、iPSC-derived NSC、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- iPSC-derived neuron
iPSC-derived NSC - 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- CAGE-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- nAnT-iCAGE
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 47–50 bp