データセット ID
JGAD000395
- データの種類
- NGS（scRNA-seq、bulk RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 363 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0130
- 公開日
- 2022-09-15
- 更新日
- 2022-09-15
- DDBJ Search
- JGAD000395 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000289 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- POEMS症候群（ICD10：C90.2）：4症例
多発性骨髄腫（ICD10：C90.0）：3症例
正常コントロール（骨髄浸潤のないリンパ腫）：2症例 - 対象者数9 (人数)
- 疾患
- POEMS症候群 (C902)
多発性骨髄腫 (C900) - 試料説明
- POEMS症候群、多発性骨髄腫、骨髄浸潤のない悪性リンパ腫の腫瘍細胞（CD138陽性骨髄形質細胞）から抽出したRNA
- 組織骨髄
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 60 bp
scRNA-seq
- 材料と対象者
- POEMS症候群（ICD10：C90.2）：11症例（うち1症例はJGAD000226と重複）
多発性骨髄腫（ICD10：C90.0）：2症例
MGUS（ICD10：D47.2）：2症例
正常コントロール （骨髄浸潤のない悪性リンパ腫）：2症例 - 疾患
- POEMS症候群 (C902)
多発性骨髄腫 (C900)
MGUS (D472) - 試料説明
- POEMS症候群、多発性骨髄腫、MGUS、骨髄浸潤のない悪性リンパ腫の腫瘍細胞（CD138陽性骨髄形質細胞）から抽出したRNA
- 組織骨髄
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 断片化
- Tagmentation using Nextera XT DNA Sample Preparation kit（Illumina）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp