データセット ID
JGAD000387
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 196 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0266
- 公開日
- 2022-12-28
- 更新日
- 2022-12-28
- DDBJ Search
- JGAD000387 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000281 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 天疱瘡（ICD10：L10.0/L10.2）：3症例（細胞数）
治療開始前デスモグレイン特異的B細胞（37、30、36）
治療開始前非デスモグレイン特異的B細胞（44、40、44）
内1例は治療開始後のデスモグレイン特異的B細胞と非デスモグレイン特異的B細胞（31、96）も含む
健常人：3名（細胞数）
インフルエンザHA特異的B細胞（48、36、36）
非インフルエンザHA特異的B細胞（48、48、48） - 健康状態混在
- 対象者数6 (人数)
- 疾患
- 天疱瘡 (L100, L102)
- 試料説明
- 抗原特異的B細胞から抽出したRNA
- 組織B 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Nextera XT DNA Library Prep Kit
SMART-Seq HT Kit - 断片化
- Nextera XT DNA Library Prep Kit
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp