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NBDC ヒトデータベース
JGAD000385
公開日
2021-04-12

更新日
2021-04-13

研究
hum0216

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000279

解析手法

WES

材料と対象者

大腸がん(ICD10: C18.9): 7症例(15検体) (腫瘍組織、非腫瘍組織のペア) (1症例は横行結腸の腫瘍組織、S状結腸の腫瘍組織、および非腫瘍組織)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [NovaSeq 6000]

試料説明

大腸がんの腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit SureSelect Human All Exon Kit v5

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

150 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

137 GB (fastq)

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