データセット ID
JGAD000385
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 137 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0216
- 公開日
- 2021-04-12
- 更新日
- 2021-04-12
- DDBJ Search
- JGAD000385 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000279 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 大腸がん（ICD10：C18.9）：7症例（15検体）
（腫瘍組織、非腫瘍組織のペア）
（1症例は横行結腸の腫瘍組織、S状結腸の腫瘍組織、および非腫瘍組織） - 健康状態罹患
- 対象者数7 (人数)
- 疾患
- 大腸がん
- 試料説明
- 大腸がんの腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina
SureSelect Human All Exon V5 - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp