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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000373

データの種類
NGS(RNA-seq:全身性強皮症)
アクセス制限
制限公開(Type I)
研究
hum0214
公開日
2022-03-16
更新日
2022-03-16

解析手法

ATAC-seq

材料と対象者
全身性エリテマトーデス(ICD10:M329):8症例
対照健常者:8名
  • 健康状態
    健常
疾患
  • 全身性エリテマトーデス
試料説明
末梢血免疫細胞15画分(Naive_B, SM_B, USM_B, DN_B, Plasmablast, Th1, Th2, Th17, Tfh, Naive_CD4, Mem_CD4, Naive_CD8, CD16p_Mono, CD16n_Mono, NK)より抽出したDNA
試料の入手元
N/A
実験方法
ATAC-seq
測定対象
N/A
試薬キット
Fast-ATAC-seq
断片化
Fast-ATAC-seq protocol
プラットフォーム
Illumina HiSeq 2500
リードタイプ
ペアエンド
リード長
102 bp