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NBDC ヒトデータベース
JGAD000373
公開日
2022-03-16

更新日
2026-06-09

研究
hum0214

データの種類
NGS(RNA-seq: 全身性強皮症)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000220

解析手法

ATAC-seq

材料と対象者

全身性エリテマトーデス(ICD10: M329): 8症例 対照健常者: 8名

実験方法

ATAC-seq

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500]

試料説明

末梢血免疫細胞15画分(Naive_B, SM_B, USM_B, DN_B, Plasmablast, Th1, Th2, Th17, Tfh, Naive_CD4, Mem_CD4, Naive_CD8, CD16p_Mono, CD16n_Mono, NK)より抽出したDNA

ライブラリ構築

Fast-ATAC-seq protocol

断片化

Fast-ATAC-seq protocol

リードタイプ

Paired-end

リード長

102 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

27 GB(tdf、bed)

利用ポリシー