データセット ID
JGAD000349
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 27.8 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0247
- 公開日
- 2021-01-05
- 更新日
- 2021-01-05
- DDBJ Search
- JGAD000349 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000249 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 悪性黒色腫(ICD10:C43.3、C43.7):3症例
腫瘍組織:3検体
非腫瘍組織(PBMC):3検体 - 健康状態罹患
- 対象者数3 (人数)
- 疾患
- 悪性黒色腫 (C433, C437)
- 試料説明
- 悪性黒色腫の腫瘍組織およびPBMCから抽出したDNA
- 組織末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37