データセット ID
JGAD000348
- データの種類
- NGS(CAGE-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 42.5 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0249
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000348 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000248 (新しいタブで開きます)
解析手法
CAGE-seq
- 材料と対象者
- 鎖骨頭蓋骨異形成症(ICD10:Q870):3症例
頬粘膜線維芽細胞から樹立したiPS細胞から分化させた骨芽細胞:2症例(2検体)
頬粘膜線維芽細胞から樹立したiPS細胞に対して遺伝子編集により変異を正常化させたiPS細胞から分化させた骨芽細胞:1症例(1検体) - 健康状態罹患
- 対象者数3 (人数)
- 疾患
- 鎖骨頭蓋骨異形成症 (Q870)
- 試料説明
- iPS細胞から分化させた骨芽細胞から抽出したRNA
- 組織Osteoblast
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- CAGE-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- nAnT-iCAGE
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NextSeq 500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 47 bp