データセット ID
JGAD000342
- データの種類
- NGS（Amplicon-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 202 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0111
- 公開日
- 2021-03-08
- 更新日
- 2021-03-08
- DDBJ Search
- JGAD000342 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000242 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA Amplicon-seq
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16）：102症例（腫瘍組織と非腫瘍組織のペア）
内87症例はJGAD000104、JGAD000210と重複 - 健康状態罹患
- 対象者数102 (人数)
- 疾患
- 胃がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Amplicon-seq
- 測定対象
- IgHV、IgKV、IgLV遺伝子のV領域からC領域まで
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 300 bp