データセット ID
JGAD000324
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 727 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- TXT
- CSV
- TAR
- 研究
- hum0229
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2025-10-29
- DDBJ Search
- JGAD000324 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000230 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| commitment_ | 257 KB | ||
| commitment_ | 140 KB |
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- スーパーセンチナリアン：7名
（total RNA library：7名、TCR library：2名）
家族：2名
血縁関係のない対照者：2名 - 健康状態健常
- 対象者数11 (人数)
- 年齢層高齢者
- 試料説明
- total RNA library：末梢血単核球（PBMC）から抽出したRNA
TCR library：末梢血CD4+ T Cellから抽出したRNA - 組織CD4 陽性 T 細胞、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- TCR library：TCR領域
- 試薬キット
- Chromium Single Cell 3' v2
Chromium Single Cell 5'
Chromium Single Cell V(D)J Enrichment Kit - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 全RNAライブラリ: 98 bp
TCRライブラリ: 150 bp