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NBDC ヒトデータベース
JGAD000320
公開日
2021-12-02

更新日
2021-12-02

研究
hum0227

データの種類
NGS(Exome、RNA-seq)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000228

解析手法

WES

材料と対象者

胃がん(ICD10: C16): 102症例 腫瘍組織: 102検体 非腫瘍組織: 102検体

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500]

試料説明

手術摘出切片の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

Agilent SureSelect Human All Exon Kit v4 and v5+ LincRNA

断片化

超音波断片化(Covaris SS)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

3 TB(fastq)

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