データセット ID
JGAD000320
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 3.5 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0227
- 公開日
- 2021-12-02
- 更新日
- 2021-12-02
- DDBJ Search
- JGAD000320 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000228 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 胃がん（ICD10：C16）：102症例
腫瘍組織：102検体
非腫瘍組織：102検体 - 健康状態罹患
- 対象者数204 (検体数)
- 疾患
- 胃がん
- 試料説明
- 手術摘出切片の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織胃
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA - 断片化
- 超音波断片化（Covaris SS）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp