データセット ID
JGAD000319
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.4 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0156
- 公開日
- 2021-12-22
- 更新日
- 2021-12-22
- DDBJ Search
- JGAD000319 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000227 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 食道がん（ICD10：C159）：33症例
腫瘍組織：52検体
末梢血：33検体 - 健康状態罹患
- 対象者数85 (検体数)
- 疾患
- 食道がん
- 試料説明
- 食道がんの腫瘍組織および末梢血から抽出したDNA
- 組織食道、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp