データセット ID
JGAD000316
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 15.8 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0221
- 公開日
- 2023-07-31
- 更新日
- 2023-07-31
- DDBJ Search
- JGAD000316 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000225 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- ファブリー病（ICD10：E752）2症例より樹立したiPS細胞株：3細胞株
- 健康状態罹患
- 対象者数3 (検体数)
- 疾患
- ファブリー病 (E752)
- 試料説明
- 末梢血より樹立したiPS細胞から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 101 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- STAR（version 2.7.1a）
- 解析方法
- RSEM（version 1.2.31）、アノーテーション：Ensembl ver. 98
- リード数
- Total reads: 35447368.83（mean） / Uniquely mapped reads: 33238808.83（mean）
- 加工データの種類
- TPM