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NBDC ヒトデータベース
JGAD000307
公開日
2021-04-02

更新日
2024-11-25

研究
hum0200

データの種類
NGS(Exome) シングルセルCNV解析

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000202

解析手法

Targeted DNA sequencing

材料と対象者

浸潤性乳管がん(ICD10: C509): 2症例 非浸潤性乳管がん(ICD10: D051): 72症例

実験方法

Target Capture

ターゲット
プラットフォーム

Illumina [NovaSeq 6000]

試料説明

腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect XT custom capture library

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

200 bp(100 PE)

JGAデータセットAccession
総データ量

455 GB(fastq)

利用ポリシー