データセット ID
JGAD000304
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 14.2 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0107
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2021-04-20
- DDBJ Search
- JGAD000304 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000218 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- ヒトの基底細胞母斑症候群（ICD10：Q859）1症例
口腔粘膜由来の線維芽細胞より樹立したiPS細胞から分化した骨芽細胞：3サンプル
線維芽細胞セルラインより樹立したiPS細胞から分化した骨芽細胞：3サンプル - 健康状態罹患
- 対象者数6 (検体数)
- 疾患
- ヒトの基底細胞母斑症候群 (Q859)
- 試料説明
- 口腔粘膜およびセルラインの線維芽細胞より樹立したiPS細胞から分化した骨芽細胞より抽出したRNA
- 組織口腔粘膜、Osteoblast
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- iPSC
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- HiSeq SBS Kit v4
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 125 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38