データセット ID
JGAD000292
- データの種類
- NGS（PBAT-seq、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 218 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0206
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000292 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000207 (新しいタブで開きます)
解析手法
PBAT-seq
- 材料と対象者
- CHM（ICD10：O01）：3症例
TS細胞：3検体 - 健康状態罹患
- 対象者数3 (検体数)
- 疾患
- CHM (O01)
- 試料説明
- CHM由来CT細胞から樹立したTS細胞株から抽出したDNA
- 組織栄養膜幹細胞
- 細胞株
- Stem cell
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- PBAT-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Post-Bisulfite Adaptor-Tagging (PBAT)
- 断片化
- PBAT法による（Bisulfite変換に伴うDNA切断）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 101 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- CHM（ICD10：O01）：3症例
CT細胞：2検体
TS細胞：3検体 - 健康状態罹患
- 対象者数5 (検体数)
- 疾患
- CHM (O01)
- 試料説明
- CHMの胎盤から単離したCT細胞およびCT細胞から樹立したTS細胞株から抽出したmRNA
- 組織細胞性栄養膜細胞、栄養膜幹細胞
- 細胞株
- Stem cell
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 101 bp