データセット ID
JGAD000291
- データの種類
- NGS(Target Capture)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 274 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- VCF
- 研究
- hum0203
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2025-10-27
- DDBJ Search
- JGAD000291 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000206 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0203-GeneList.xlsx | 340遺伝子+免疫グロブリン再構成領域(IGH, IGK, IGL) | 14.4 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 多発性骨髄腫(ICD10:C900):154症例
原発巣:154検体
再発巣:6検体
末梢血単核球細胞:23検体 - 健康状態罹患
- 対象者数183 (検体数)
- 疾患
- 多発性骨髄腫 (C900)
- 試料説明
- 骨髄穿刺にて採取した骨髄液をCD138にてソートした凍結骨髄細胞および末梢血単核球細胞より抽出したDNA
- 組織骨髄、末梢血単核球 (PBMC)、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 試薬キット
- SureSelect Custom
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris ME220)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100–200 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- 加工データの種類
- 変異コール