データセット ID
JGAD000279
- データの種類
- NGS(Target Capture)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 476 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0192
- 公開日
- 2021-04-23
- 更新日
- 2021-04-23
- DDBJ Search
- JGAD000279 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000196 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 大腸・直腸がん(ICD10:C18.9、C20 ):20症例
- 健康状態罹患
- 対象者数20 (人数)
- 疾患
- 大腸・直腸がん (C189, C20)
- 試料説明
- 末梢血(血漿)から抽出したcell free DNA
- 組織血漿
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- NCC Oncopanel v2
https://www.ncc.go.jp/jp/information/pr_release/2019/0529/index.html - 試薬キット
- SureSelect XT HS
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 300 bp