データセット ID
JGAD000264
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 946 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0152
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000264 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000182 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 脱分化型脂肪肉腫（ICD10：C480, C490, C492, C493）：37症例
- 健康状態罹患
- 対象者数37 (人数)
- 疾患
- 脱分化型脂肪肉腫 (C480, C490, C492, C493)
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 脱分化型脂肪肉腫（ICD10：C480, C490, C492, C493）：37症例
- 健康状態罹患
- 対象者数37 (人数)
- 疾患
- 脱分化型脂肪肉腫 (C480, C490, C492, C493)
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ribo-Zero Gold Kit
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75 bp