データセット ID
JGAD000263
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 53.9 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0088
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000263 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000077 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 神経膠芽腫（ICD10：C71.9）：2症例（TGS-01、TGS-04）
- 健康状態罹患
- 対象者数2 (人数)
- 疾患
- 神経膠芽腫 (C719)
- 試料説明
- RNA抽出24時間前に、(1) Ad-EPHA6(WT)、Ad-EPHA6(K757R)もしくはAd-LacZを感染し、(2) BMP-2で刺激もしくは無刺激とされた、神経膠芽腫から樹立したグリオーマ幹細胞株（TGS-01）より抽出したmRNA
- 組織Glioma stem cell
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- Glioma stem cell line
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ion Total RNA-Seq Kit v2
- 断片化
- Ion Proton：酵素反応（RNase III）
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion Proton
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- Ion Proton: 200 bp