データセット ID
JGAD000250
- データの種類
- NGS（Exome、Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 694 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0176
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000250 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000172 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 子宮がん肉腫（ICD10：C549）：1症例（2検体）
卵巣がん肉腫（ICD10：C56）：3症例（6検体） - 健康状態罹患
- 対象者数4 (人数)
- 疾患
- 子宮がん肉腫
- 卵巣がん肉腫
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 101 bp
Targeted DNA sequencing (CS-A/CS-B panels)
- 材料と対象者
- 子宮がん肉腫（ICD10：C549）：91症例（182検体）
卵巣がん肉腫（ICD10：C56）：14症例（28検体） - 健康状態罹患
- 対象者数105 (人数)
- 疾患
- 子宮がん肉腫
- 卵巣がん肉腫
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- CS-A: 491 genes, 2.605 Mbps
CS-B: 114 genes, 422.9 kbps - 試薬キット
- SureSelect Custom
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 101 bp