データセット ID
JGAD000236
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 3.1 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0140
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000236 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000158 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 術前に化学放射線療法を受けた直腸がん（ICD10：C20 [NG80]）：74症例（計148検体）
- 健康状態罹患
- 対象者数74 (人数)
- 疾患
- 術前に化学放射線療法を受けた直腸がん
- 試料説明
- 原発巣の腫瘍組織および非腫瘍組織（もしくは末梢血）から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Custom V5
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 200 bp