データセット ID
JGAD000212
- データの種類
- NGS（WGS）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 441 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0143
- 公開日
- 2025-05-13
- 更新日
- 2025-05-13
- DDBJ Search
- JGAD000212 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000143 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- HPDE細胞
（プロ）レニン受容体を過剰発現（persistent）させたHPDE-1/E6E7細胞：1検体
（プロ）レニン受容体を過剰発現（transient）させたHPDE-1/E6E7細胞：1検体
空ベクターを導入した（persistent）HPDE-1/E6E7細胞：1検体
空ベクターを導入した（transient）HPDE-1/E6E7細胞：1検体
ベクターを導入していないHPDE細胞（HPDE-1/E6E7、HPDE-6/E6E7）：2検体 - 対象者数6 (検体数)
- 試料説明
- 細胞株から抽出したDNA
- 組織Pancreatic ductal epithelial cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- HPDE-1/E6E7
HPDE-6/E6E7 - 試料の入手元
- HPDE-1/E6E7、HPDE-6/E6E7
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化 （Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 125 bp