データセット ID
JGAD000133
- データの種類
- NGS（Target Capture）：AML Cancer Panel
NGS（Target Capture）：41遺伝子 - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 454 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0116
- 公開日
- 2020-11-24
- 更新日
- 2020-11-24
- DDBJ Search
- JGAD000133 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000122 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- AML（ICD10：C920）：19症例
白血病幹細胞33検体、Pre-白血病幹細胞2検体、T細胞6検体、B細胞2検体（計43検体）
19症例のうち12症例の白血病幹細胞を輸注した免疫不全マウス（ヒト化マウス）の内、白血病を発症したヒト化マウス37匹から採取したヒト白血病細胞37検体 - 健康状態罹患
- 対象者数19 (人数)
- 疾患
- AML
- 試料説明
- 白血病幹細胞、Pre-白血病幹細胞、T細胞、B細胞から抽出したDNA
白血病幹細胞を輸注した免疫不全マウス（ヒト化マウス）の内、白血病を発症したヒト化マウスから採取したヒト白血病細胞から抽出したDNA - 組織B 細胞、Leukemia stem cell、Pre-leukemic stem cell、T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- xGen® Acute Myeloid Leukemia Cancer Panel
- 試薬キット
- KAPA Hyper Prep Kit
xGen Acute Myeloid Leukemia Cancer Panel - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 50 bp