2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000133
- 公開日
- 2020-11-24
- 更新日
- 2025-12-04
- 研究
- hum0116
- データの種類
- NGS(Target Capture): AML Cancer Panel NGS(Target Capture): 41遺伝子
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000122
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
AML(ICD10: C920): 19症例 白血病幹細胞33検体、Pre-白血病幹細胞2検体、T細胞6検体、B細胞2検体(計43検体) 19症例のうち12症例の白血病幹細胞を輸注した免疫不全マウス(ヒト化マウス)の内、白血病を発症したヒト化マウス37匹から採取したヒト白血病細胞37検体
- 実験方法
Target Capture
- ターゲット
xGen® Acute Myeloid Leukemia Cancer Panel
- プラットフォーム
Illumina [HiSeq 1500]
- 試料説明
白血病幹細胞、Pre-白血病幹細胞、T細胞、B細胞から抽出したDNA 白血病幹細胞を輸注した免疫不全マウス(ヒト化マウス)の内、白血病を発症したヒト化マウスから採取したヒト白血病細胞から抽出したDNA
- ライブラリ構築
KAPA Hyper Prep kit xGen@ Acute Myeloid Leukemia Cancer Panel
- リードタイプ
Single-end
- リード長
50 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
423 GB(fastq)
- 利用ポリシー