データセット ID
JGAD000111
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.4 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0094
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000111 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000105 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 肺腺がん（ICD10：C349）：43症例
- 健康状態罹患
- 対象者数43 (人数)
- 疾患
- 肺腺がん
- 試料説明
- 乳がん、肺腺がん、大腸がん、デスモイド腫瘍、肺多形がんおよび唾液腺導管がんの切除標本、凍結検体ならびにFFPE（腫瘍組織）から抽出したRNA
- 組織乳房、大腸、肺、唾液腺、軟部組織
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina
TruSeq RNA Exome - 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 肺腺がん: 103 bp