データセット ID
JGAD000092
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 733 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0095
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000092 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000092 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 大腸腺腫もしくは大腸がん早期病変：計10症例
63検体（腫瘍組織：53検体、非腫瘍組織（正常大腸粘膜組織）：10検体） - 健康状態混在
- 対象者数10 (人数)
- 試料説明
- 大腸腺腫もしくは大腸がん早期病変の腫瘍組織と非腫瘍組織（正常大腸粘膜組織）より抽出したDNA
- 組織結腸
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp