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NBDC ヒトデータベース
JGAD000092
公開日
2020-09-28

更新日
2020-09-28

研究
hum0095

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000092

解析手法

WES

材料と対象者

大腸腺腫もしくは大腸がん早期病変: 計10症例 63検体(腫瘍組織: 53検体、非腫瘍組織(正常大腸粘膜組織): 10検体)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500]

試料説明

大腸腺腫もしくは大腸がん早期病変の腫瘍組織と非腫瘍組織(正常大腸粘膜組織)より抽出したDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human ALL Exon V5

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

682 GB (fastq)

利用ポリシー