データセット ID
JGAD000091
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 7.6 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0058
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000091 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000091 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 大腸がん：89症例（合計297検体）
非腫瘍組織（正常組織）：89検体
腫瘍組織（原発巣・転移巣）：208検体 - 健康状態罹患
- 対象者数89 (人数)
- 試料説明
- 大腸がん89症例の正常組織、原発巣及び転移巣の腫瘍組織より抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA - 断片化
- 超音波断片化（Covaris E220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp